2011年4月11日。両親の海外出張で日本に残された主人公は、1年間だけ母方の叔父の家に居候することになった。彼が転入した高校では、「雨の夜の午前0時に点いていないニコニコ動画で自分の顔を見つめると、別の人間が映る」という「マヨナカニコニコ」の噂が流れていた。この噂は実際に起こりつつあった怪異の一端であり、マヨナカニコニコの噂を確かめようとした主人公、純平、真はニコ生主たちの業界の存在を知ることになる。
真夜中のニコニコ（恋愛な文字人、真夜中のニコニコ？）は、2011年4月12日に日本でスタートし、2012年4月16日に終了するまで全8話が放送されたアニメオンリーのシリーズです。
物語は、ニコニコ動画に夢中になっている真夜中という女の子を中心に展開されています。彼女は不思議な夢をたくさん見て、ニコニコと同じような未来を見ることができる不思議な能力を持っています。