とある少年は、クラスで独り浮いていました。名前はアルフィー・プラット。剣術を習っていて、いつかハリウッドに行くことを夢見ている。彼はいつも学校で本を読んだり勉強をして過ごしています。誰も話しかけてくるクラスメイトはいません。彼はそんなことも気にせずに過ごしています。放課後になって周りを避けるように学校を出ていき家に帰宅します。
しかししばらくして、母親が旅に出ようとしていることを知る。クリスマス前に戻ってくると言っていたのに、一向に戻ってこない。アルフィーは母が何をしに出かけたのか漠然とした心当たりはあるが、このまま母が見つからなければどうやって探せばいいのかわからない。 彼は路上で、家のない生活を送っている。この町には知り合いもいないし、誰からも好かれていない。自分がなぜここにいるのかはわからないが、自分が幸せでないことはわかっている。そこで彼はほんの一瞬、自分の人生を変えることを決意する。忍者になるのだ。 忍者とは何か？忍者とは、12歳までにステルスと暴力の技術を習得した人間のことだ。それは孤独で、透明で、無力な人生である。しかし彼は、自分が共同体に提供できる大きなものがあることに気づく。彼は使命を持った忍者なのだ。