植物の発生と周囲の環境の関係について

植物の発生と周囲の環境の関係について

(A)ファイトケミカルを生産・代謝する微生物のin-silico(その場)マッピング。 (B)ファイトケミカルを代謝する真菌のin-situ(その場)マッピング。 (C)ファイトケミカル生合成に関連する植物遺伝子のサブセットのインシリコ(in situ)マッピング (D)ファイトケミカル代謝に関連する植物および真菌遺伝子のin-situ(その場)マッピング。 (E)ファイトケミカルの生合成に関連する植物遺伝子のサブセットのin-silico(その場)マッピング。 (F)多様なファイトケミカルの生合成に関連する植物および真菌遺伝子のin situマッピング。 これらの遺伝子をマッピングするために、多様な環境から収集した数千のファイトケミカルサンプルを解析するインシリコアプローチを用いた(図1A)。次に、これらの植物や真菌の群集における遺伝子発現レベルを、実験室で栽培した同じ群集における発現レベルと比較した。このアラインメントを実験室での同じ遺伝子の発現レベルと比較すると、これらの植物や菌類の発現プロファイルに関連する「植物化学物質ターゲット」(または遺伝子セット)が特定された。これらの遺伝子は、植物化学物質の生合成における重要なステップを触媒する酵素をコードしているため、これらの各遺伝子のインシリコモデルをマッピングするために、植物化学物質代謝に関連する上位10遺伝子を選択した

Photo by James St. John

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