このアニメは鉄器時代の文化と現代の技術が混ざった未来世界を舞台としています。ストーリーにもその世界観が生かされています。
物語は、ファーストガンダムシリーズの完結から約1年後に始まります。地球はガンダムと呼ばれる宇宙海賊に侵略されていた。ガンダムは世界中の都市を攻撃するが、地球軍は再建され、ガンダムパイロットの装甲に組み込まれたデンドロビウムと呼ばれる謎の機械の助けを借りて、ガンダムの攻撃を撃退することができるようになっていた。
このシリーズは、デンドロビウムが主要な兵器となっている地球連邦政府の未来が舞台となっています。物語は、ガンダムパイロットたちのガンダムとの戦いを描いています。
ストーリーは主にアニメ「ガンダムX」をベースにしていますが、いくつかの重要な違いがあります。